現在わんことだけで暮らしていますがひとりぼっちで留守番させて…

おそらく分離不安だと思います。
ぽっきーくんは飼い主さんのことが大好きなので、一人でお留守番するのはやはりとても寂しいのでしょう。
普段から一人でも時間を過ごせる練習をするほか、一人で何時間も遊んでいられるおもちゃなどを与えてなんとか寂しさを紛らわせてあげるといいと思います。
念の為再度トイレのしつけを、留守番しているときも出来るよね、などと話しかけながらしてみるといいと思います。