犬種なのかもしれませんが、うちの子は兎に角狭い場所が大好きで…

これはわんちゃんのDNAですね。
狼だった時代からですが、土などに横穴を掘ったりして暮らしていた名残りでしょう。
他の生き物に狙われないように、狭くて暗いところに身を潜めていたそうです。
犬小屋やハウス、クレートなど狭い場所にいることで安心するので、特に心配することはないと思います。