深夜、車に反応して吠えることがあると指摘されました。（昼間は…

わんちゃんは見知らぬモノや人、音などに恐怖心を感じるそうです。
ですので、車が自分や飼い主さんに対して何もしないと理解させると安心すると思います。
また、夜に目を覚ましたときの分離不安も考えられますので、飼い主さんのすぐそばで眠るようにしてあげるのもいいかなと思います。

ワンちゃんは外の音などに敏感なので夜中に車の音に反応しているのかもしれないです。
対処法としてはなるべく車の音が聞こえない場所に居させるというのが良いと思います。
特に夜は不安になるワンちゃんもいると思うのでそこは気を付けた方が良いかもしれないです。