食事はきちんと食べるのに食事以外の時間にペットシーツを食べて…

トイレシートを狙って食べてるんでしょうか？
うちの犬も小さい頃ありましたが、ひまつぶしでトイレシートで遊んでて、ちぎれたのを食べちゃう子もいます。

とりあえずトイレシートの吸水部分は食べちゃうとお腹のなかでふくらんで危険なので、トイレトレーをあみのタイプにしたほうがいいかと思います。
うちの犬も小さい頃にお留守番中トイレシートで遊んでちぎってて、端のビニールのところ少し食べちゃっててヒヤヒヤしました。
それ以来ずっとあみすのこのトイレトレーにしてます。

あとはお留守番中ひまなのかもしれないので、お留守番前に多めに散歩してつかれさせたり、おやつを入れられる知育おもちゃでひまつぶしできるようにしたりしてあげるといいかもと思います。