夜に寝てる途中に泣いたり、慣れているはずなのに吠えること…

いろいろ原因は考えられると思います。
ある時間になると、人には聞こえないけどわんちゃんには何か聞こえてそれに反応している。
夜中にふと目を覚ましたときに真っ暗なのが急に気になるようになった。
そのとき飼い主さんの姿が見えなくて不安になって吠えている。
思い当たる原因を調べていけば何かしらわかってくると思います。
また、定期検診のおりにでもドクターに相談されてもいいかもしれません

ストレスを感じているせいでそのようなことになっているのかもしれないです。
対策としてはどのようなことでストレスを感じているかを見てストレスを解消してあげるのが良いと思います。
そうすれば夜中に吠えるということもなくなるかと思います。