子犬の頃から食欲にムラがあり食べない時は全然食べません。年を…

あくまで知り合いの飼い主さんから聞いた話ですが、やはり食べない場合は一度片付けた方がいいそうです。
食べないで残すことがストレスになってしまうわんちゃんもいるそうなので。
例えば量が多い、食器が食べづらい、フードが好みでない、口の中、歯、胃腸系の不調などなどいろいろあると思います。
食べている様子を見て、食べ終わったかなというタイミングで一度片付けてみてはいかがでしょうか。
ごちそうさま、といった感じなのか、まだ食べたがるのか、それとも食べづらそうだったのか、わんちゃんの様子で何かわかるかもしれません。