平日は、毎日6時間ほどのお留守番をしています。 昼間は、畳2…

もしかしたらですが、それが一種のルーティーンになってしまっているのかもしれないですね。
留守番する、寝る、飼い主さんが帰ってくる、散歩する、楽しい、ちょっと興奮している、少し寝る、起きて遊ぶ、など興奮が残っているかもしれません。
散歩は大事ですが、留守番したときの散歩を抜かすなどルーティーンをちょっと崩して様子をみるでしょうか。
または留守番カメラで話しかけて寝ないようにするなども考えられると思います。
昼夜逆転のようなので元に戻してあげるといいかもしれません。