1歳2カ月のシーズーを飼っています。夜、主人の布団の上で寝る…

昼間、在宅されていてもサークルの中では静かにできていますでしょうか？
人が誰かいるとサークルにいるのが難しいなら、昼間から徐々に慣らすといいと思います。

かわいいからつい、サークルをずっと開けてしまうんですが慣れてくると、眠い時は勝手に入って寝ています。

まずはサークルではなく、クレートに入れて、ご主人のベッドの近くに置いてみては。
うちの場合はクレートに入れてバスタオルを被せて、私ベッドサイド下、頭の位置に置きました
真夏は避けた方がいいですが、タオルをかけることによって
吠え声を抑えられますし暗いので安心感も得られます。
最初は多少は吠えますが、近所迷惑になるほどではないと思います。
クレート広すぎず中にフラットのベッドを入れたりバスタオルを敷いて
一回転できるくらいの大きさを。
「巣」に近い状態を作ります。
いきなり別室にするよりスムーズかもしれません。
クレートに慣れたら、別室のサークルの中にクレートごと置いてみましょう
もし、クレートを使わないでサークルのみにする場合でも
天井をつけて、バスタオルタオルケットで覆うと良いと思います。
個人的にはクレートの方がおすすめですが。