うちに来て約半年になりますが、未だになじんでないというか不安…

もしかしたらケージやハウスなどの場所が落ち着かない可能性はあるかもしれないですね。
わんちゃんは自分の安心安全な場所にいたがりますのでその点の見直しでしょうか。
また、うちの柴くまのように食事やトイレや寝床などの場所にも結構神経質なわんちゃんはいますので、そのあたりもでしょうか。