一人で平気な時間が以前よりは増えましたが、それでもひとりだと…

小さい時からずっと続いていますか？
甘やかしすぎると分離不安のような症状も出てくる様なので、適度な距離感が良いと思います。
対処方法ですが、例えば、スマホなどで動画を撮ってみて、どのくらい猫ちゃんの不安が続くか確認してみてください。
長く不安が続く様であれば、猫ちゃんのストレスがあると思いますので、帰って来てから、いっぱい甘やかしてあげると良いと思いますよ^ ^

ネコちゃんとのコミュニケーションの時間が少ないのかもしれないですね。
なので今まで以上にコミュニケーションの時間を増やしてあげることでネコちゃんも寂しさを感じて問題行動を取ることもなくなるかと思いますのでもっとコミュニケーションの時間を増やして欲しいと思います。