隠れるのが好きなのか家の中でよく所在不明になるので探すと狭い…

うちの柴くまもいまだになんでこんな狭いところに入っているの？みたいな暗くて狭い場所でじっとしていることがあります。
わんちゃんは野生時代に横穴を掘ってその中で外敵から身を守ったりしていたそうです。
わんちゃんの本能なので防ぐのは難しいと思います。
見つかりにくい場所や出られにくい場所に入らないように気をつけてあげた方が安全だと思います。

隙間が好きな犬はダックスフント以外でもいるんで、そのこの性格でもあるし、犬の性質でもあるんじゃないかなと思います。

困るのはどこにいるかわからなくて危ないかな？ってことなら、せまめのクレートをおうち用におちつけそうな場所においてあげるといいと思います。
うちの犬は普段はソファやクッションなど好きなところで好きに寝てますが、たまーにクレートへ入って静かに落ち着きたいときもあるみたいで、部屋の隅のクレートの奥の方で寝てることもあります。