夜中に二階建ての家の一階で何もいないところに向かって吠える。…

人には聞こえない音やなんかに反応してるのではないかなと思います。
道を自転車が通ったとか。

うちも引っ越し前は２階建て戸建てでしたが、うちの犬は夜にたまに一階の天井角に向かってめちゃくちゃ吠えることがあって、子供が「オバケでもいるの？！怖い！」ってよく言ってました。

調べてみたら、大昔は「犬の吠え声には退魔のちからがある」と信じられてたらしいんで、子供にはもしオバケがいたとしても今の吠え声でどっか行ったよ、と伝えてました。