十分に食事(朝、晩の1日2食で1回25g)は上げているのです…

何kgあり、どの程度の運動量があるチワワちゃんか存じませんが、成犬で食事量が1日50gは少ないと感じてしまいます。
2kg以上あるなら1食で50〜60gでもいい気がします。
もしかしたらお腹が空いていて食糞しているのかもしれません。
食事が原因でない場合、以下の可能性もあります。
・飼い主さんがリアクションをすることで構ってもらえると学習していることがある
・うんちをしたら食べる前にすぐに片付ける
・退屈、暇に感じでいるとストレスで食べることがある
・消化不良など体内に原因がある場合もある

トレーニング方法の例として
排泄したら呼び戻しをする。こちらに来たタイミングでたくさん褒める。繰り返すことで、排泄したときに毎回知らせてくれるようになります。